En 2025, 77 sites de baignade naturelle ont fait l'objet d'un contrôle sanitaire de la qualité de l'eau en Bourgogne-Franche-Comté. Les résultats témoignent d'une situation globalement satisfaisante :  87 % des sites sont classés en qualité bonne ou excellente ; 6,5 % en qualité suffisante ; 2,6 % en qualité insuffisante. Trois sites n'ont pas fait l'objet d'un classement, soit parce qu'ils sont nouvellement recensés, soit parce qu'ils ont connu une fermeture temporaire sur une partie de la période de référence.

Pour la saison 2026, 78 sites de baignade naturelle sont recensés en Bourgogne-Franche-Comté. Six sites ne seront pas ouverts au public cette saison pour différents motifs, notamment des travaux, des difficultés d'organisation de la surveillance ou, dans certains cas, des raisons sanitaires (classement insuffisant 5 années consécutives).

Une surveillance sanitaire tout au long de la saison

L’ARS met en œuvre une surveillance sanitaire réglementaire de l'ensemble des sites de baignade ouverts au public. Ce contrôle comprend des analyses microbiologiques de l'eau, ainsi que des relevés de paramètres physico-chimiques réalisés régulièrement tout au long de la saison balnéaire. Un premier prélèvement est effectué avant l'ouverture du site, puis des contrôles sont réalisés à intervalles réguliers. Sur certains sites identifiés comme sensibles, une surveillance complémentaire des cyanobactéries est également mise en place. Cette organisation permet de suivre en continu la qualité des eaux et de mettre en œuvre, si nécessaire, les mesures adaptées pour garantir la protection des baigneurs.
En cas de dégradation ponctuelle de la qualité de l'eau susceptible de présenter un risque sanitaire, des mesures de gestion peuvent être prises par les responsables des sites, notamment une fermeture temporaire accompagnée d'une information du public.
Une information accessible à tous

Tout au long de la saison estivale, les résultats des contrôles effectués par l’ARS sont consultables sur le lieu de baignade et en mairie (obligation réglementaire), et sur le site internet du ministère en charge de la santé. Le public dispose également de l’historique des classements, ainsi que des informations concernant le cadre réglementaire, les conseils sanitaires relatifs à la baignade et aux activités connexes.

Des conseils pour profiter pleinement de la baignade

En plus de l'aspect sanitaire, les comportements individuels ont toute leur part à jouer pour profiter pleinement de la baignade. 
Les fortes chaleurs augmentent le risque de noyade (fatigue, déshydratation, chocs thermiques) : au cours de l’été 2025, en France, 1 418 noyades accidentelles ont été recensées, dont 409 suivies de décès (29%), un chiffre en hausse par rapport à la même période en 2024 (respectivement de +14 % et +16 %). Il est donc recommandé de se baigner dans des secteurs surveillés, d'accompagner les enfants, d'entrer progressivement dans l'eau et de ne pas se baigner dans les 2h suivant un repas copieux ou une consommation d'alcool. Il est également conseillé de se protéger de la chaleur et de la déshydratation, en limiant l'exposition au soleil et en se protégeant avec des crèmes solaires, des chapeaux et lunettes.

L'ARS rappelle aussi l'existence de la leptospirose, une maladie rare transmise par contact avec une eau contaminée et conseille de privilégier les sites de baignade où la qualité de l’eau est surveillée et d'éviter de se baigner dans une eau trouble ou boueuse ; de protéger soigneusement les plaies avec un pansement imperméable ; et de prendre une douche savonneuse après la baignade ; et de consulter son médecin en cas de fièvre, de maux de tête ou de douleurs musculaires dans les semaines suivant une baignade en eau douce.